Futsal IAIN Pontianak dimulai sejak tahun 2013 diasuh oleh Coach Handes. Dari IAIN Pontianak masih berstatuskan STAIN Pontianak, dan alih status IAIN Pontianak di tahun 2014. Futsal IAIN Pontianak semakin mantap sejak memiliki Gedung Futsal sendiri. Pembinaan dapat dilakukan kontinyu bersama berjalannya waktu berkembang hingga sekarang.